1962 wurde er am Kilianeum Miltenberg zunächst Präfekt, 1967 Direktor. 1976 übernahm Bauer die Pfarrei „Unsere Liebe Frau“ in Aschaffenburg, 1977 auch die Aufgabe des Präses der Kolpingsfamilie Aschaffenburg-Stadt. 1981 wurde er zudem Bezirkspräses der Kolpingsfamilien im Bezirksverband Aschaffenburg, 1980 auch Dekanatspräses für Liturgie und Kirchenmusik sowie 1982 Präses der Marianischen Männer-Sodalität. 1996 war Bauer außerdem Prokurator des Dekanats, seit Juli 1996 auch Schulbeauftragter. 2003 wurde er in den Ruhestand versetzt. Seitdem hilft Bauer in den Innenstadtpfarreien Aschaffenburgs in der Seelsorge mit und nimmt weiterhin seine Aufgaben für die Kolpingsfamilien wahr.
Die Pfarreiengemeinschaft St. Martin feiert deb Geburtstag in der 10 Uhr - Messe in der Muttergottes-Pfarrkirche in Aschaffenburg. An dieser Messe nimmt der dann frisch geweihte Diakon Alexander Berger aus der Pfarrei Zu Unserer Lieben Frau teil.